一、从习惯于分散自由研究探索，向面向重大科学问题、面向国家重大战略需求的定向基础前沿研究、关键核心高技术创新和重大系统集成创新、可持续发展相关基础和系统研究为主的创新活动转变。

二、从以论文、奖励数量质量评价为主，实现向以创新实际贡献、创新发展态势、创新质量水平为主评价的跨越；以比较关注同行评价为根据，实现向更加关注实际贡献和经受实践和历史检验和评价的转变。

三、从注重科技创新向同时重视转移转化转变。

四、从注重个别优秀人才引进，实现向按照创新需求和发展布局，择优引进培养，优化人才结构，建设一流创新队伍转变。

五、从以传统的PI创新基础单元形式，实现向适应自由探索科学原创、大科学研究、高技术前沿探索、关键核心技术攻关、重大系统集成创新、长期系统数据检测与积累、转移转化研究等多样的创新织组形式转变。

六、从以学科为基本依托的研究所法人创新组织单元，向以研究所和以面向重大创新战略目标为组织依据的“创新基地”构成的矩阵网格式的创新组织管理体制转变。

七、从注重科技创新，出一流成果，向同时注重人才培养和教育创新，重视创新环境建设和管理创新，实现“一流成果、一流管理、一流环境、一流人才”转变。

八、从历史形成的我院地域分布结构，向与我国经济社会区域发展格局和资源生态环境区域特点更相适应、更相协调的创新布局转变。

九、从主要依靠国家投入为主，实现向依靠国家稳定投入为主，有效吸纳地方、企业、社会和全球多元资源集成的格局转变。